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パスキーを作成するとパスワードなしでログインできる。2段階認証プロセスが有効な場合も、パスキーは「2つ目の手順」として使え、その場合は手順が省略される。職場・学校のGoogle Workspaceアカウントでは、管理者の設定によりパスキーのみでのログインが制限される場合がある。

ログインはID＋パスワードのみ。新しいブラウザからのログイン時などに通知メールが送られるが、コード入力式の追加認証ではない。二段階認証・認証アプリ・パスキーの設定案内は公式FAQになし

ログインはID＋パスワードのみ。ポイント交換時もログインパスワードの再入力で確認する方式で、SMS/メールコード・認証アプリ・パスキー等の追加認証は公式FAQに案内なし

2要素認証として認証アプリ（TOTP）のほかU2F/FIDO2セキュリティキーを登録可能（併用も可）。セキュリティキーはパスワード入力後の第2要素専用で、Protonアカウント自体へのパスキーによるパスワードレスログインには対応していない。

個人アカウントでパスキーを作成でき、顔・指紋・PIN・セキュリティキーでパスワードなしにサインインできる（アカウントからパスワード自体を削除する設定もあり）。パスワード入力後の第2要素としてパスキーを使う形は公式資料で確認できなかったためmfaはunknown。なお2段階認証自体はMicrosoft Authenticatorアプリ等で別途提供されている。